Китайці створили метод читання РНК зі старих тканин

Китайські вчені розробили інноваційний інструмент картування РНК, що відкриває нові горизонти дослідження давніх біозразків — від ракових тканин до мозку Ейнштейна.

Команда з BGI-Research презентувала Stereo-seq V2 — метод просторової транскриптоміки нового покоління. Ця технологія дає змогу аналізувати РНК навіть у зразках, які понад десятиліття зберігались у несприятливих умовах. Вперше вдалося точно картографувати РНК на клітинному рівні у старій пухлині, виявивши підтипи раку та імунні реакції. «Ми прагнемо вдихнути життя у біологічні архіви минулого», — заявила Ляо Ша, технічна директорка STOmics.

Звичайно, виклик полягає у хімічному пошкодженні тканин, збережених у формаліні та парафіні (FFPE), що раніше унеможливлювало повноцінний аналіз. Stereo-seq V2 використовує хімію з випадковим праймом, забезпечуючи повне покриття гена навіть у деградованих зразках. Метод уже застосовується для дослідження туберкульозу, дозволяючи одночасно вивчати РНК людини та збудника. «Ми ретельно перевіряємо якість кожного зразка перед аналізом», — підкреслює Ляо.

За оцінками вчених, у лікарнях світу зберігаються мільйони зразків FFPE, багато з яких залишалися недосяжними для генетичних досліджень. Лі Ян із BGI наголошує: «Це шанс дослідити рідкісні захворювання, для яких зразки накопичуються роками». Новий підхід може прискорити діагностику, допомогти в персоналізації лікування та активізувати архівні дослідження.

«Якщо нам пощастить, ми могли б спробувати проаналізувати мозок Ейнштейна», — зазначив Лі Ян. Хоча техніка збереження у 1955 році була далека від сучасної, сама поява такого інструменту відкриває наукові двері, які ще вчора здавались зачиненими.